Tras el alzamiento de varios cultos genestealer, instalados en las catacumbas más profundas de varias ciudades colmena, el mundo Nugratis se ve inmerso en una situación insostenible; no solo por el alzamiento de cultos xenos, sino porque la baliza psíquica fue lo suficientemente potente como para reclamar la atención de un de los tentáculos de la flota enjambre más cercana.
En un mundo en el que los mutantes son temidos y odiados por la humanidad, existe un pequeño halo de luz que busca la coexistencia entre humanos y mutantes. Los X-men, liderados por el profesor Charles Xavier, son héroes que con sus increíbles poderes luchan en proteger a todo el mundo.
El hogar de los X-men, la escuela Xavier para jóvenes talentos ha sido reconstruida tras el último ataque de Magneto y su Hermandad. El profesor reúne de nuevo a sus queridos X-men para una nueva misión: buscar y preparar a una nueva generación de jóvenes mutantes.